Вариант SARS-CoV-2, получивший название Омикрон был впервые обнаружен в провинции Гаутенг (Южная Африка). Анализ секвенирования всего генома показал, что этот вариант сильно мутировал и имел почти 40 мутаций только в белке шипа. Учитывая большое количество мутаций и значительно повышенную трансмиссивность, Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) назвала Омикрон вариантом, вызывающем беспокойство.
В Южной Африке около 81% всех случаев COVID-19 в ноябре и 96% всех случаев COVID-19 в декабре были идентифицированы как вызванные вариантом Омикрон. Это ознаменовало начало четвертой волны COVID-19 в Южной Африке. Во время первой, второй и третьей волн доминирующими вариантами были соответственно исходный штамм SARS-CoV-2 с мутацией D614G, вариант Бета и вариант Дельта. Что касается охвата вакцинацией, то около 31% взрослого населения провинции Гаутенга были вакцинированы до начала четвертой волны.
Предварительные исследования динамики передачи вируса показали, что вариант Омикрон имеет значительно более высокую инфекционность, чем ранее доминировавший Дельта-вариант. Более того, этот вариант обладает высокой способностью уклоняться от иммунных ответов хозяина и вызывать повторные инфекции и прорывные инфекции после вакцинации. Однако до сих пор не ясно, является ли этот вариант более вирулентным, чем его предшественники.
В текущем исследовании ученые сравнили частоту госпитализаций и тяжесть заболевания среди пациентов инфицированных Бетой, Дельтой и Омикроном, которые были госпитализированы во время второй, третьей и четвертой волн пандемии соответственно. В анализ были включены случаи, выявленные в течение первых четырех недель каждой волны пандемии.
В течение первых четырех недель волн Бета, Дельта и Омикрона количество выявленных случаев COVID-19 в провинции Гаутенг составило 41046, 33423 и 133551 человек соответственно. Однако резкий всплеск заболеваемости Омикроном не вызывал увеличения количества госпитализаций. Среди выявленных случаев COVID-19 во время второй, третьей и четвертой волн около 18%, 13% и 4% были госпитализированы соответственно.
Что касается клинических исходов, около 60% случаев Бета, 66% случаев Дельта и 28% случаев Омикрона прогрессировали до тяжелого заболевания. Тяжесть заболевания в этом исследовании определялась как развитие острого респираторного дистресс-синдрома, потребность в дополнительном кислороде, введение инвазивной искусственной вентиляции легких, лечение в отделении интенсивной терапии (ОИТ) или смерть.
В частности, процент пациентов, нуждающихся в дополнительном кислороде, был значительно ниже во время волны Омикрона по сравнению с Бета и Дельта волнами. Средняя продолжительность пребывания в больнице для инфицированных Бетой, Дельтой и Омикроном составляла 7 дней, 8 дней и 4 дня соответственно. В целом госпитализированные пациенты с омикронной инфекцией на 73% меньше подвержены развитию тяжелого заболевания по сравнению с дельта-инфицированными пациентами.
Примечательно, что во время первых четырех недель волны Омикрона было госпитализировано значительно больше молодых людей в возрасте до 20 лет. Их число составило 17%, тогда как во время предыдущих волн оно не превышало 4%. Впрочем, среди госпитализированным молодых людей тяжелое заболевание развивалось все равно реже, чем у их сверстников инфицированных Бета- или Дельта-вариантами.
Таким образом, авторы исследования предполагают, что Омикрон имеет относительно более низкую вирулентность по сравнению со своими предшественниками, что и является причиной более легкого течения болезни. Однако нельзя исключать и иммунитет, который люди уже приобрели к SARS-CoV-2 в результате естественной инфекции или вакцинации.
Читайте также: Исследование: Омикрон имеет самый короткий инкубационный период из всех вариантов SARS-CoV-19
Использованы фото Shutterstock/FOTODOM UKRAINE
Jassat W. (2021). Clinical Severity of COVID-19 Patients Admitted to Hospitals in Gauteng, South Africa During the Omicron-Dominant Fourth Wave. The Lancet Preprint. doi: http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.3996320 https://papers.ssrn.com/sol3/papers.cfm?abstract_id=3996320
